WebDec 18, 2024 · ChIP-Atlas收集整理了SRA 数据库 中的大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了后续分析，将分析结果整理成在线服务并发布，方便检索与查询，网址如下. 下载SRA原始数据，采用 sratoolkit 转换成fastq, 然后用 bowtie2 比对参考基因组，用 macs2 进行peak calling。. 官网 ... Web文献「ChIP-Atlas 公開チップ-seqデータの完全統合により駆動されたデータマイニング・スイート【JST・京大機械翻訳】」の詳細情報です。J-GLOBAL 科学技術総合リンクセンターは研究者、文献、特許などの情報をつなぐことで、異分野の知や意外な発見などを支援する新しいサービスです。
ChIP-Atlas: Target Genes
WebJan 24, 2024 · ChIP-Atlas は、論文などで報告された ChIP-seq データを閲覧し、利活用するためのウェブサービスです。 データ処理の知識やスキルがない方でも簡単に利用できます。データソースは、公開 NGS データレポジトリ (NCBI, EMBL-EBI, DDBJ) に登録されたほぼ全ての ChIP-seq データです。 WebChIP library_construction_protocol Whole cell extracts were sonicated to solubilize the chromatin. The chromatin extracts containing DNA fragments with an average size of 250 bp were immunoprecipitated using different antibodies. For Myc, TEAD, Histone Marks, RNAPol2 ChIP, 3T9 fibroblasts or dissected liver/tumors were fixed with 1% formaldehyde. csuf women of zalongo
【How to use2】ChIP-Atlas の使い方 @ AJACS番町3 - YouTube
Web在研究gene regulation的过程中，最常见的一个问题就是这个gene的上游是什么，调控它的转录因子（TF）是什么。. 在没有任何思路的情况下，不妨尝试用现有的public chip-seq的数据来看一看调控这个基因的TF都有什么。. 进入Chip-Atlas的Enrichment Analysis. 2. 选 … WebFeb 5, 2024 · ChIP-Atlasを使って既報のChIP-seqデータをまとめて閲覧する 〜Peak Browserの使い方〜. http://togotv.dbcls.jp/20240123.html ChIP-Atlas は、論文などで報 … WebThe Integrative Genomics Viewer (IGV) is a high-performance, easy-to-use, interactive tool for the visual exploration of genomic data. It supports flexible integration of all the common types of genomic data and metadata, investigator-generated or publicly available, loaded from local or cloud sources. igv.js - a JavaScript component that can ... early stages shingles symptoms on neck